在三国志11中，要想提升自己的实力，通过积累技巧值并且利用这些技巧值研究科技就是非常重要的措施，都能提升本势力的即战力。比如研究四大兵种的科技，就能提升对应兵种的战斗力；研究“熟练兵”能提升部队的士气值上限，让部队能打出更多的战法伤害。
总之，所有科技的研究绝对都是有好处的，也是非常必要的一项措施。但是，这里面需要注意的是，有些科技研究成功过后，同时也会出现一些副作用，不少玩家可能忽视了这些弊端。对此，以下就是专门针对三国志11存在副作用的科技所给出的介绍。
通过火陷阱来进行野战输出威力也是不容小觑的，往往这也是对付难缠的敌将非常有效的措施，毕竟不需要正面对抗。而游戏里威力最高的火陷阱，还是要数“练成炸药”后的火科技，因为能放置“业火球”和“业火种”这种威力巨大的火陷阱，不仅伤害的范围广，而且所造成的基础伤害也更加大。
但这里需要注意的是，“业火球”和“业火种”这两种陷阱是非常致命的，不分敌我，只要在陷阱的触发范围内都会遭受伤害，且武将还有致死的可能。相信不少人都有操作失误的时候，让己方大将被这种陷阱炸死。而且就算是敌方大将，被炸死也是很可惜的，因为永久丧失了将其纳入麾下的机会。最后还有一个点需要特别指出的是，我方研究成功“练成炸药”这个科技后，敌方普通的火陷阱伤害针对我方部队竟然也会伤害大增，这无疑又是一个负面影响！
在游戏里围绕港口有一个著名的“坑兵战术”，具体的情况是，在己方港口遭到敌方大军围殴的时候，为了减少损失，将战果最大化，可以选择主动放弃己方的港口，将港口里的兵力钱粮等资源，全部搬运出去，同时派部队堵住敌方上岸的入口，往往这个时候，敌方的大部队都会主动进入这个刚占领的港口。
由于刚占领的港口耐久度只有原先耐久度的一半，也就是1000左右，对此，我方只要派提前准备好的两个冲车部队，不费一兵一卒，1个回合就能重新夺回这个港口，一次性让敌方损失好几万的兵力，还能缴获不少物资，甚至是俘获敌将。这就是著名的“港口坑兵战术”。
但是如果研究了“强化城墙”这个科技后，所有据点的耐久度会翻倍，港口也不例外，因此刚占领的港口耐久度往往是2000往上，这时2个冲车必然是不够用的，导致了港口坑兵战术极难执行成功，无疑，这就是强化城墙这个科技最大的一个副作用，加固了自己城墙的同时，竟然也间接加固了敌方的城墙。
骑射这个科技提升的是骑兵的战斗力，因为让骑兵有了远程攻击的能力。但是跟弩兵一样，也有同样的一个毛病，如果让部队委任攻击，那么在进行最后一击的时候，电脑习惯性地不采用贴身攻击，常常喜欢运用骑射攻击。这样的后果是，得不到战利品，缴获不了敌方部队的钱粮，同时也会大大减低捕获敌将的概率。因此骑射这个科技，还是略有瑕疵的。
神火计的作用是，让部队可在周围3格范围放火计，这大大提升了火计的计略范围。可以看出，一般来说，神火计跟炸药陷阱是绝配，毕竟能让己方部队在一个安全的区域给敌军一个致命一击，同时还不会伤到自己。但神火计有一个问题是，提升了委任部队的瞎操作空间。在游戏里我们会经常会发现，水军部队总喜欢呆在水里往岸上的设施放火，就算本身是攻城部队，依然不情愿登录，白白浪费自身的士气值。